Exoma Completo: Telangiectasia hemorrágica hereditaria y otras vasculopatías

Información clínica

La telangiectasia hemorrágica hereditaria (THH), también conocida como la enfermedad de Osler-Weber-Rendu, es un trastorno genético que causa una alteración en los vasos sanguíneos que puede ocasionar hemorragias excesivas. En concreto, afecta el desarrollo de los vasos sanguíneos dando lugar a conexiones anómalas conocidas como malformaciones arteriovenosas, las cuales se forman entre las arterias y las venas. Los órganos más afectados incluyen los labios, la nariz, la lengua y los dedos de las manos. Sin embargo, también se pueden desarrollar en los pulmones, el cerebro y el hígado. La manifestación más destacada de esta condición suele ser la presencia de hemorragias nasales espontáneas y sin causa aparente, a veces sucediendo de manera diaria.

El estudio genético de estas patologías proporciona información crucial para establecer un diagnóstico preciso y una clasificación acertada. Además, permite llevar a cabo un asesoramiento genético, mejorar el pronóstico y manejo de estos pacientes y contribuir a la investigación y al desarrollo de terapias.

Indicación de estudio

Confirmación de la sospecha clínica o analítica de la patología. Esta prueba está especialmente indicada en el caso de enfermedades con diferentes genes candidatos o con un fenotipo sin una base genética clara.

Utilidad diagnóstica

Identificar las variantes genéticas relacionadas con la sospecha clínica de un trastorno hemorrágico hereditario.

Método

Secuenciación del exoma completo (Whole Exome Sequencing; WES) para la identificación de variantes patogénicas. El estudio del WES se basa en la captura de ADN fragmentado, proveniente de sangre total, a partir de la hibridación de sondas específicas. Esta prueba permite la secuenciación de todo el exoma humano, que comprende las regiones genómicas codificantes (exones) para proteínas y las regiones intrónicas flanqueantes de todos los genes. A continuación, se utiliza un panel de genes virtuales seleccionado en función de la patología de estudio (ver apartado panel de genes) para limitar y acotar el análisis genético a aquellos genes relacionados con el fenotipo del paciente.

Especialmente en el estudio de fenotipos complejos o en el caso de una difícil valoración de las variantes identificadas se recomienda el análisis de tríos (paciente y dos familiares directos). Esta estrategia puede simplificar y reforzar los análisis, ofreciendo información sobre la herencia de la enfermedad.

Por último, la/s mutación/es candidatas detectadas por NGS se recomprueban por secuenciación tradicional de Sanger, para llegar a un resultado inequívoco. Probablemente será necesario el diseño de cebadores específicos para analizar la región concreta donde se encuentra la variante.

En el caso de no identificar ninguna mutación candidata a ser causante (o potencialmente causante) de la patología se informará y discutirá con el equipo médico solicitante la posibilidad de realizar estudios complementarios.

Panel de genes

El estudio genético de la THH y otras vasculopatías similares analiza 16 genes. Los genes del panel se han seleccionado cuidadosamente a partir de la literatura científica, las bases de datos de mutaciones y la experiencia propia. Es importante destacar que este panel se actualiza periódicamente en función de los conocimientos vigentes permitiendo modificar la selección de genes candidatos y reanalizar los resultados. Sin embargo, bajo petición del facultativo responsable, se pueden analizar otros genes que no se contemplan en el panel virtual y que pueden estar relacionados con características clínicas determinadas. Esto es posible gracias a la secuenciación completa del exoma.

Limitaciones

Esta prueba no detecta:

• Variants estructurales como inversiones complejas
• Conversiones genéticas
• Translocaciones equilibradas
• Expansiones repetitivas de nucleótidos
• Variants en regiones intrónicas profundas.

Es posible que esta prueba no detecte de manera fiable:

• Indels superiores a 50 pb
• Supresiones o duplicaciones de exones únicos
• Variants dentro de regiones pseudogénicas/segmentos duplicados.

Valores de referencia

No aplica

Algoritmo diagnóstico

No aplica

Tiempo de respuesta

8 semanas

Información sobre el espécimen

Muestra: Sangre total

Tubo: Tubo EDTA K3 de 5-10 ml si se trata de una muestra de sangre

Volumen mínimo imprescindible: 3 ml

Estabilidad:

• A temperatura ambiente: 4 días
• En refrigeración: 10 días

Instrucciones de transporte: Preferiblemente a temperatura ambiente

Motivo de rechazo: Muestra coagulada y/o incorrectamente identificada

Otros tipos de muestras aceptadas:

• DNA purificado: mínimo 300 ng (30 ng/µL). El volumen recomendado es un mínimo de 60 µl
• Mucosa bucal: contactar con el laboratorio para consultar especificaciones de recogida de la muestra

Información administrativa

Código BST: LRD2829

Descripción de la prueba: Estudio Exoma Completo

Sinónimos: Secuenciación del exoma completo, WES, estudio molecular de enfermedades con base genética.

Sección: Coagulopatías Congénitas

Tarifa BST: Consulte las tarifas actualizadas haciendo clic aquí.

En la hoja de petición de estudio molecular se debe marcar la casilla Otros, especificar que se quiere estudiar el exoma completo y completar (adjuntar) los datos fenotípicos de los que se disponga.

Referencias

• Centers for Disease Control and Prevention website. Blood disorders: facts about hereditary hemorrhagic telangiectasia (HHT). www.cdc.gov/ncbddd/hht/. Updated April 28, 2023. Accessed May 1, 2023.
• Cappell MS, Lebwohl O. Hereditary hemorrhagic telangiectasia. In: Lebwohl MG, Heymann WR, Coulson IH, Murrell DF, eds. Treatment of Skin Disease. 6th ed. Philadelphia, PA: Elsevier; 2022:chap 102.
• Protocolo Nextera Flex for Enrichment Reference Guide (1000000048041) de Illumina.

Base de dades de mutacions

• Human Gene Mutation Database: http://www.hgmd.cf.ac.uk
• Leiden Open Variation Database: https://databases.lovd.nl/shared/genes
• Genome Aggregation Database: https://gnomad.broadinstitute.org
• 1000 Genomes Database: https://www.internationalgenome.org